ヴェルナー２世（Werner II）とは、ドイツの君主・諸侯の名前。
- ヴェルナー２世 (ヴァラホ家) ： ドイツ中南部のフランケン貴族のヴァラホ家（Walaho-Haus）のヴェルナー１世の子、ヴェルナー３世の父、ヴェルナー４世の祖父。同時に東フランク王のアルヌルフ２世の岳父でツヴェンツィボルトの外祖父。ヴォルムスガウ（ヴォームスガウ）伯およびシュパイアーガウ伯。
- ヴェルナー２世 (ハプスブルク家) ： スイス北部の貴族で、ハプスブルク家のクレットガウ伯のラートボート（Radbot）の子、オットー１世・アルプレヒト１世の弟、オットー２世・アルプレヒト２世の父。ハプスブルク朝の祖のひとりにあたる。
- ヴェルナー２世 (ボーランデン家) ： ドイツ中西部のラインラント＝プファルツ地方の貴族のボーランデン家の当主でありヴェルナー１世の子でありヴェルナー３世の父、マインツ辺境伯。1190年にシュテレンベルク城を築城した（[1]）。